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思想是什么，人的思想从哪里来？为什么两个人的思想会有所不同？什么样的思想是正确的？什么样的是错误的，如何面对各种思想？
以上这些是本文要初步归纳的问题。
人的思想从哪里来，这个问题太难，它涉及到物质的人何以会产生意识的思想，如果承认意识的物质性，又必然要面对人死后是否有灵魂这样的问题，只好不谈，先解决思想是什么的问题。
在没有认识电脑前，我认为思想好比一个系统树，因为在此之前只少许接触了一下系统论。由此给思想的定义为：思想就是用来认识和解决问题的一个系统。它无比庞大，被置于意识深处，以供随时调用。
思想的实质，其实就是认识的有序堆积。这些对世界的认识以树形存放在一起，用来对新事物作比较分析。这些认识包括对事物的感性认识，譬如树的枝叶，也包括对事物发生过程的记录，譬如树干中的脉络。之所以会是树形，因为每个人的思想发展多不是均衡的，虽然都有很多树叶，但多数人的思想都在某一枝杈上突出的枝繁叶茂。那种整棵树都庞大无比的思想树不是没有，但绝对不会很多。
树的成长过程决定它的特点——哪个部分功能多一点，哪个部分容易出错。对某一事物的初次认识决定多数人在这方面的思想基础，对则对矣，错则错矣。而那些因特殊原因在某方面多做留连（兴趣）的人，则有机会改正初次认识时可能发生的错误，并使这一部分的思想得以进一步强大。
因为看事物的角度不同，所以某一事物占据思想树的位置和形式也有所不同。这就是同一事物被不同人的思想处理后表现出不同面貌的原因。这种不同有形式上的，也有本质上的。但不论哪种不同，大多都是先前思想树的一种映射，只有一少部分来源于先天的一棵小思想树——本能的无形影响。好象上帝说过“原谅他们吧，因为他们所做的他们自己并不知道”（大意），应该就是这个原因。
正确的思想来源于对事物的本身及其发生过程的正确认识和了解。思想之树并不包括所有经历过的事物，但一旦那些经历过的事物被归纳为系统树的一部分，就将影响后来事物的映射。而且思想树的另一个特点是，先前占据某位的东西，很不情愿为后来者让位，即使后来者是正确的。这就是心理学上的所知障，是思想成熟，发展的阻力之一。
思想作为一种大的应用程序，与心理，意识虽不能截然分开，但也并非同一事物。思想的成长与应用可以受自主意识，也就是超我控制。很多时候，人对事物的认识，或说怎样认识是可以调节的。思想也多不直接参与指导行为，而要通过意识中的一些其它东西才能做到。可见思想只是人脑中的应用程序之一而非全部。
物质是否由同一的微粒以不同形式堆积而成，好象还没有定论，但思想却有着这方面的特性。如果有人能进入思想的世界，他会看到一个由很多人的思想树加在一起组成的森林，而这些树对照于现实事物虽有正误的不同，但无自身本质的正误。唯心者认为，世界就是以我意识中的形式存在，以我的灭亡而灭亡的，这种观点由来已久，自然也有其部分合理性，物质世界既然有不同形式的堆积，思想也当有，故不可强求统一。只是作为应用程序，吸取功能更为强大者的建构应该是一个渐趋完美的捷径。